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The B73 Maize Genome: Complexity, Diversity, and Dynamics

生物 驯化 基因组 单倍型 转座因子 进化生物学 遗传学 遗传多样性 基因组进化 参考基因组 杂合子丢失 核苷酸多样性 基因 等位基因 人口 人口学 社会学
作者
Patrick S. Schnable,Doreen Ware,Robert S. Fulton,Joshua C. Stein,Fusheng Wei,Shiran Pasternak,Chengzhi Liang,Jianwei Zhang,Lucinda Fulton,Tina Graves,Patrick Minx,Amy Denise Reily,Laura Courtney,Scott Kruchowski,Chad Tomlinson,Cindy Strong,Kim D. Delehaunty,Catrina C. Fronick,Bill Courtney,Susan M. Rock
出处
期刊:Science [American Association for the Advancement of Science]
卷期号:326 (5956): 1112-1115 被引量:3976
标识
DOI:10.1126/science.1178534
摘要

A-Maize-ing Maize is one of our oldest and most important crops, having been domesticated approximately 9000 years ago in central Mexico. Schnable et al. (p. 1112 ; see the cover) present the results of sequencing the B73 inbred maize line. The findings elucidate how maize became diploid after an ancestral doubling of its chromosomes and reveals transposable element movement and activity and recombination. Vielle-Calzada et al. (p. 1078 ) have sequenced the Palomero Toluqueño ( Palomero ) landrace, a highland popcorn from Mexico, which, when compared to the B73 line, reveals multiple loci impacted by domestication. Swanson-Wagner et al. (p. 1118 ) exploit possession of the genome to analyze expression differences occurring between lines. The identification of single nucleotide polymorphisms and copy number variations among lines was used by Gore et al. (p. 1115 ) to generate a Haplotype map of maize. While chromosomal diversity in maize is high, it is likely that recombination is the major force affecting the levels of heterozygosity in maize. The availability of the maize genome will help to guide future agricultural and biofuel applications (see the Perspective by Feuillet and Eversole ).
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