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A novel transformer‐based ECG dimensionality reduction stacked auto‐encoders for arrhythmia beat detection

过度拟合 计算机科学 人工智能 模式识别(心理学) 降维 心律失常 自编码 编码器 支持向量机 深度学习 变压器 节拍(声学) F1得分 心磁图 循环神经网络 机器学习 人工神经网络 工程类 心房颤动 心脏病学 电压 医学 物理 声学 电气工程 操作系统
作者
Ding Chun,Shenglun Wang,Xiaopeng Jin,Zhaoze Wang,Junsong Wang
出处
期刊:Medical Physics [Wiley]
卷期号:50 (9): 5897-5912 被引量:9
标识
DOI:10.1002/mp.16534
摘要

Electrocardiogram (ECG) is a powerful tool for studying cardiac activity and diagnosing various cardiovascular diseases, including arrhythmia. While machine learning and deep learning algorithms have been applied to ECG interpretation, there is still room for improvement. For instance, the commonly used Recurrent Neural Networks (RNNs), reply on its previous state to update and is therefore ineffective for parallel computing. RNN also struggles to efficiently address the issue of long-distance reliance.To reduce computational complexity by dimensionality reduction of ECG signals we constructed a Stacked Auto-encoders model using Transformer for ECG-based arrhythmia detection. And overcome the challenges of long-term dependencies and limited parallelizability in traditional RNNs when applied to ECG signal processing.In this paper, a Transformer-Based ECG Dimensionality Reduction Stacked Auto-encoders model is proposed for ECG-based arrhythmia detection. The transformer is used to encode ECG signals into a feature matrix, which is then dimensionally reduced using unsupervised greedy training through the four linear layers. This resulted in a low-dimensional representation of ECG features, which are subsequently classified using support vector machines (SVM) to minimize overfitting.The proposed method is benchmarked on the MIT-BIH Arrhythmia database. In the 10-fold cross validation of beat-based arrhythmia detection, the average accuracy, sensitivity, specificity and F1 score of the proposed method are 99.83%, 98.84%, 99.84% and 99.13%, respectively, for the record-based arrhythmia detection which refers to the approach where the training and testing sets use ECG data from independent recorded patients are 88.10%, 49.79%, 91.56% and 39.95%, respectively.Compared to other existing ECG-based arrhythmia detection methods, our proposed approach exhibits improved detection accuracy and stronger generalization for arrhythmia beats. Additionally, the use of the record-based data division method makes our approach more suitable for clinical practice.
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