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Identification of potential anti-hyperglycemic compounds in Cordyceps militaris ethyl acetate extract: in vitro and in silico studies

极化率 蛋白质数据库 虫草素 化学 生物信息学 对接(动物) 计算化学 立体化学 生物化学 有机化学 医学 分子 护理部 基因
作者
Thanh Q. Bui,Ton That Huu Dat,Phan Tứ Quý,Nguyễn Thị Thanh Hải,Thai Minh Nguyen,Vinh Phu Nguyen,Lê Văn Tuấn,Lam K. Huynh,Mai Suan Li,Nguyen Thi Ai Nhung
出处
期刊:Journal of Biomolecular Structure & Dynamics [Taylor & Francis]
卷期号:: 1-17 被引量:1
标识
DOI:10.1080/07391102.2023.2283156
摘要

Cordyceps militaris has been long known for valuable health benefits by folk experience and was recently reported with diabetes-tackling evidences, thus deserving extending efforts on screening for component-activity relationship. In this study, experiments were carried out to find the evidence, justification, and input for computations on the potential against diabetes-related protein structures: PDB-4W93, PDB-3W37, and PDB-4A3A. Liquid chromatography identified 14 bioactive compounds in the ethyl acetate extract (1-14) and quantified the contents of cordycepin (0.11%) and adenosine (0.01%). Bioassays revealed the overall potential of the extract against α-amylase (IC50 = 6.443 ± 0.364 mg.mL-1) and α-glucosidase (IC50 = 2.580 ± 0.194 mg.mL-1). A combination of different computational platforms was used to select the most promising candidates for applications as anti-diabetic bio-inhibitors, i.e. 1 (ground state: -888.49715 a.u.; dipole moment 3.779 Debye; DS¯ -12.3 kcal.mol-1; polarizability 34.7 Å3; logP - 1.30), 10 (ground state: -688.52406 a.u.; dipole moment 5.487 Debye; DS¯ -12.6 kcal.mol-1; polarizability 24.9 Å3; logP - 3.39), and 12 (ground state: -1460.07276 a.u.; dipole moment 3.976 Debye; DS¯ -12.5 kcal.mol-1; polarizability 52.4 Å3; logP - 4.39). The results encourage further experimental tests on cordycepin (1), mannitol (10), and adenosylribose (12) to validate their in-practice diabetes-related activities, thus conducive to hypoglycemic applications.Communicated by Ramaswamy H. Sarma.
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