Genetic investigation of fibromuscular dysplasia identifies risk loci and shared genetics with common cardiovascular diseases

全基因组关联研究 肌纤维发育不良 遗传关联 生物 疾病 遗传学 医学 单核苷酸多态性 生物信息学 内科学 基因 基因型 肾动脉
作者
Adrien Georges,Min-Lee Yang,Takiy-Eddine Berrandou,Mark K. Bakker,Ozan Dikilitas,Soto Romuald Kiando,Lijiang Ma,Benjamin A. Satterfield,Sebanti Sengupta,Mengyao Yu,Jean‐François Deleuze,Delia Dupré,Kristina L. Hunker,Sergiy Kyryachenko,Lu Liu,Ines Sayoud-Sadeg,Laurence Amar,Chad M. Brummett,Dawn M. Coleman,Valentina d’Escamard
出处
期刊:Nature Communications [Nature Portfolio]
卷期号:12 (1) 被引量:56
标识
DOI:10.1038/s41467-021-26174-2
摘要

Fibromuscular dysplasia (FMD) is an arteriopathy associated with hypertension, stroke and myocardial infarction, affecting mostly women. We report results from the first genome-wide association meta-analysis of six studies including 1556 FMD cases and 7100 controls. We find an estimate of SNP-based heritability compatible with FMD having a polygenic basis, and report four robustly associated loci (PHACTR1, LRP1, ATP2B1, and LIMA1). Transcriptome-wide association analysis in arteries identifies one additional locus (SLC24A3). We characterize open chromatin in arterial primary cells and find that FMD associated variants are located in arterial-specific regulatory elements. Target genes are broadly involved in mechanisms related to actin cytoskeleton and intracellular calcium homeostasis, central to vascular contraction. We find significant genetic overlap between FMD and more common cardiovascular diseases and traits including blood pressure, migraine, intracranial aneurysm, and coronary artery disease.
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