Identification of Lactate-Related Gene Signature for Prediction of Progression and Immunotherapeutic Response in Skin Cutaneous Melanoma

医学 黑色素瘤 肿瘤科 基因签名 内科学 恶性肿瘤 队列 免疫系统 免疫疗法 肿瘤微环境 皮肤癌 癌症 免疫学 基因 癌症研究 生物 基因表达 遗传学
作者
Yalin Xie,Jie Zhang,Mengna Li,Yu Zhang,Qian Li,Yue Zheng,Lai Wei
出处
期刊:Frontiers in Oncology [Frontiers Media SA]
卷期号:12 被引量:13
标识
DOI:10.3389/fonc.2022.818868
摘要

Skin cutaneous melanoma (SKCM) is a skin cancer type characterized by a high degree of immune cell infiltration. The potential function of lactate, a main metabolic product in the tumor microenvironment (TME) of SKCM, remains unclear. In this study, we systemically analyzed the predictive value of lactate-related genes (LRGs) for prognosis and response to immune checkpoint inhibitors (ICIs) in SKCM patients included from The Cancer Genome Atlas (TCGA) database. Cluster 3, by consensus clustering for 61 LRGs, manifested a worse clinical outcome, attributed to the overexpression of malignancy marks. In addition, we created a prognostic prediction model for high- and low-risk patients and verified its performance in a validation cohort, GSE65904. Between TME and the risk model, we found a negative relation of the immunocyte infiltration levels with patients' risk scores. The low-risk cases had higher ICI expression and could benefit better from ICIs relative to the high-risk cases. Thus, the lactate-related prognosis risk signature may comprehensively provide a basis for future investigations on immunotherapeutic treatment for SKCM.
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