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Influence of single nucleotide polymorphism in the IGF-1 gene on performance and conformation traits in Munjal sheep

基因型 生物 遗传学 单核苷酸多态性 基因 等位基因 人口 聚合酶链反应 基因组DNA 点突变 多态性(计算机科学) 等位基因频率 分子生物学 突变 医学 环境卫生
作者
Sandeep Kumar,S. P. Dahiya,Ankit Magotra,Poonam Ratwan,Yogesh C. Bangar
出处
期刊:Zygote [Cambridge University Press]
卷期号:: 1-8 被引量:1
标识
DOI:10.1017/s0967199422000545
摘要

Genetic polymorphism research in livestock species aims to assess genetic differences within and among breeds, primarily for conservation and development objectives. The aim of the present study was to determine the point mutation in the IGF-1 gene (g.855G>C and g.857G>A) and its association with performance traits in Munjal sheep. In total, 50 Munjal sheep were selected and the genomic DNA was isolated using the Automated Maxell RSC DNA/RNA purification system and the Maxwell RSC whole blood DNA kit. A reported set of primers was used to amplify the 294-bp fragment encompassing the targeted region, i.e. the 5' flanking region of the IGF-1 gene. The polymerase chain reaction product of 294-bp size harbouring the g.857G>A mutation in the 5' flanking region of the IGF-1 gene was digested with HaeII enzyme. Three possible genotypes were defined by distinct banding patterns, i.e. GG (194, 100 bp), GA (294, 194, 100 bp) and AA (294 bp) in the studied population of Munjal sheep. The genotypic and allelic frequencies of g.857G>A single nucleotide polymorphism of the IGF-1 gene indicated that the frequency of the A allele was higher in the studied population, i.e. 0.59 and the GA genotype was found to be the predominant genotype (0.66). Allele A of the IGF-1 gene was found to be associated with higher body weights and can be used in selection criteria for improving the performance of Munjal sheep. The positive effect of the IGF-1 gene on several conformational traits as observed in this study suggests that this area of the ovine IGF-I gene is particularly important and warrants further investigation on a larger population size.
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