Psychrobacter halodurans sp. nov. and Psychrobacter coccoides sp. nov., two new slightly halophilic bacteria isolated from marine sediment

生物 16S核糖体RNA 拉伤 微生物学 基因组DNA 嗜盐菌 磷脂酰甘油 系统发育树 细菌 DNA 基因 遗传学 磷脂 解剖 磷脂酰胆碱
作者
Dan-Dan Shang,Guijun Yang,Guanjun Chen,Zong‐Jun Du
出处
期刊:International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology [Microbiology Society]
卷期号:72 (1) 被引量:8
标识
DOI:10.1099/ijsem.0.005173
摘要

In this study, two bacterial strains designated F2608T and F1192T, isolated from marine sediment sampled in Weihai, PR China, were characterized using a polyphasic approach. Strains were aerobic, Gram-stain-negative and motile. According to the results of phylogenetic analyses based on their 16S rRNA genes, these two strains should be classified under the genus Psychrobacter and they both show <98.5% sequence similarity to their closest relative, Psychrobacter celer JCM 12601T. Moreover, strain F2608T showed 97.5% sequence similarity to strain F1192T. Strain F2608T grew at 4-37 °C (optimum, 30-33 °C) and at pH 6.0-9.0 (optimum, pH 6.5-7.0) in the presence of 0-12% (w/v) NaCl (optimum, 4.0-5.0%). Strain F1192T grew at 4-37 °C (optimum, 30 °C) and at pH 5.5-9.0 (optimum, pH 7.0-7.5) in the presence of 0.5-12% (w/v) NaCl (optimum, 3.0-4.0%). The genomic DNA G+C contents of strain F2608T and strain F1192T were 47.4 and 44.9 %, respectively. Genomic characteristics including average nucleotide identity and digital DNA-DNA hybridization values clearly separated strain F2608T from strain F1192T. The sole isoprenoid quinone in these two strains was ubiquinone 8 and the major cellular fatty acids (>10.0%) were C18:1ω9c and C17:1ω8c. The major polar lipids of these two strains were phosphatidylglycerol, phosphatidylethanolamine and diphosphatidylglycerol. Based on the results of polyphasic analysis, the two strains represent two novel species of the genus Psychrobacter, for which the names Psychrobacter halodurans sp. nov. and Psychrobacter coccoides sp. nov. are proposed. The type strains are F2608T (=MCCC 1K05774T=KCTC 82766T) and F1192T (=MCCC 1K05775T=KCTC 82765T), respectively.
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