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Time-resolved multiomics profiling reveals chromatin O-GlcNAc modification promotes senescence-associated transcriptional program

染色质 表观遗传学 生物 组蛋白 衰老 后生 细胞生物学 表型 计算生物学 转录因子 心理压抑 基因表达调控 功能基因组学 表观遗传学 嘉雅宠物 染色质重塑 遗传学 基因组学 转录调控 抄写(语言学) 细胞衰老 基因 组蛋白修饰酶 乙酰化 转录组 蛋白质组学 基因调控网络
作者
Nana Zhang,Ran Zhao,Xiaomin Zhong,Dong Qian,Yajie Liu,Kairan Yu,Lirui Han,Fanxu Meng,Jiawei Wu,Qianmei Chen,Xuechen Li,Qianmei Chen,Keren Zhang,Huang Huang,Jianing Zhang,Sijin Wu,Yan Ren,Wei Wang,Yubo Liu
出处
期刊:Nature Communications [Springer Nature]
标识
DOI:10.1038/s41467-025-68143-z
摘要

O-GlcNAc modification is a key cellular signal, but its role in regulating senescence-associated transcription remains poorly understood. Here, we apply a time-resolved chemical genomics strategy to map dynamic O-GlcNAc chromatin-associated proteins (OCPs) during oncogene-induced senescence (OIS) in primary human fibroblasts. Chromatin O-GlcNAc modification continues to accumulate, while 1,987 senescence-associated OCPs undergo dynamic shifts in genomic occupancy across diverse epigenetic chromatin states and display bimodal regulatory activities within the 3,466-gene senescence transcriptome. O-GlcNAc facilitates the formation of dual-function complexes: TF-SWI/SNF activates senescence-associated secretory phenotype (SASP) genes at promoters, whereas NuRD enforces the repression of cell-cycle regulators at enhancers. Furthermore, we identify O-GlcNAc modified JUN and GATAD2A as key regulators of OIS phenotypes in both in vitro and in vivo models of senescence-driven tumorigenesis. These findings reveal dynamic regulation and chromatin organization principles of O-GlcNAc-related epigenetic factors, providing insights into cellular senescence and potential therapeutic strategies.
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