SignalP 5.0 improves signal peptide predictions using deep neural networks

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作者
José Juan Almagro Armenteros,Konstantinos D. Tsirigos,Casper Kaae Sønderby,Thomas Nordahl Petersen,Ole Winther,Søren Brunak,Gunnar von Heijne,Henrik Nielsen
出处
期刊:Nature Biotechnology [Nature Portfolio]
卷期号:37 (4): 420-423 被引量:4666
标识
DOI:10.1038/s41587-019-0036-z
摘要

Signal peptides (SPs) are short amino acid sequences in the amino terminus of many newly synthesized proteins that target proteins into, or across, membranes. Bioinformatic tools can predict SPs from amino acid sequences, but most cannot distinguish between various types of signal peptides. We present a deep neural network-based approach that improves SP prediction across all domains of life and distinguishes between three types of prokaryotic SPs. SignalP 5.0 improves proteome-wide detection of signal peptides across all organisms and can distinguish between different types of signal peptides in prokaryotes.
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