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Metabolomics in plant–herbivore interactions: challenges and applications

代谢组学 生物 食草动物 代谢组 鉴定(生物学) 有机体 计算生物学 生态学 数据科学 生物信息学 计算机科学 遗传学
作者
Daniel Maag,Matthias Erb,Gaétan Glauser
出处
期刊:Entomologia Experimentalis Et Applicata [Wiley]
卷期号:157 (1): 18-29 被引量:43
标识
DOI:10.1111/eea.12336
摘要

Abstract Metabolomics as the study of the entire set of metabolites of a given organism is an important frontier in life sciences. As a tool that captures the ‘front end’ of cellular machineries, metabolomics is particularly suited to investigate biotic interactions, including for instance the interplay between plants and insects. In this review, we discuss the opportunities and challenges of metabolomics to study plant–herbivore interactions. We first present a brief overview of the typical analytical workflows used in metabolomics and their associated issues, in particular those related to metabolome coverage and compound identification. Second, recent advances in the field of plant–herbivore relationships that are promoted by non‐targeted approaches are reviewed, with examples ranging from classical herbivore resistance patterns to plant‐mediated interactions across different spatial scales and volatile‐mediated tritrophic interactions. Through general considerations and the discussion of a few selected case studies, our review highlights the potential and challenges of metabolomics as a research approach to understand biological interfaces.
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