Angiopoietin-Like Protein 2 Serves as an Independent Prognostic Biomarker and Correlates with Immune Infiltration in Osteosarcoma

骨肉瘤 免疫系统 癌症研究 基因 微阵列 基因表达 生物 数据库 计算机科学 免疫学 遗传学
作者
Huan Zhou,Guang Chen
出处
期刊:Journal of Biomedical Nanotechnology [American Scientific Publishers]
卷期号:20 (1): 127-132
标识
DOI:10.1166/jbn.2024.3750
摘要

Osteosarcoma mostly occurs in adolescents, with high disability and mortality rates and poor prognosis. Angiopoietin-like protein 2 (ANGPTL2) is a secreted glycoprotein protein, which plays important roles in cellular processes and various diseases. Microarray gene expression data GSE16088 and GSE36001 were downloaded from Gene Expression Omnibus (GEO, <ext-link ext-link-type="uri" xlink:href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo">http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo</ext-link>). The Complex Heatmap package was used to construct heatmaps, the gglot2 R language package to plot volcanoes and differential expression data, and the “VennDiagram” R language package to plot Wayne plots. Western booting and qRT-PCR was used to detect ANGPTL2 expression in osteosarcoma tissues. proteins. In addition, the GeneMANIA database (<ext-link ext-link-type="uri" xlink:href="http://www.genemania.org">http://www.genemania.org</ext-link>) was cited to predict the ANGPTL2 interaction network. We used the single-sample gene-set enrichment analysis (ss GSEA) algorithm to quantify the immune infiltration of osteosarcoma. In the GSE16088 database there were 5005 that met the selected threshold of |log2(FC)| > 1 and P <0.05, of which 2719 were highly expressed and 2286 were lowly expressed. WB and qRT-PCR results showed that ANGPTL2 was significantly up-regulated in osteosarcoma tissues. ssGSEA showed that high ANGPTL2 expression in osteosarcoma patients had a worse prognosis. ssGSEA showed that high ANGPTL2 expression was correlated with Mast cells and Th1 cells. Collectively, ANGPTL2 can be an independent prognostic biomarker and correlated with immune infiltration in osteosarcoma.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
更新
大幅提高文件上传限制,最高150M (2024-4-1)

科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
Bigweenine发布了新的文献求助10
刚刚
苏暖完成签到,获得积分10
刚刚
寒冷半雪完成签到,获得积分20
2秒前
迷路雁凡关注了科研通微信公众号
2秒前
体贴柚子发布了新的文献求助10
4秒前
5秒前
5秒前
6秒前
7秒前
8秒前
Unpaid应助小马日常挨打采纳,获得10
9秒前
10秒前
YY发布了新的文献求助10
11秒前
wss533发布了新的文献求助10
12秒前
12秒前
寒冷半雪发布了新的文献求助10
12秒前
上官若男应助嘻嘻采纳,获得10
13秒前
铭逸发布了新的文献求助20
15秒前
英俊的铭应助dingtao采纳,获得10
16秒前
科研神通应助yang采纳,获得10
17秒前
打打应助hmh采纳,获得10
18秒前
18秒前
slp完成签到,获得积分20
18秒前
JamesPei应助大气松采纳,获得10
18秒前
无花果应助Fedup采纳,获得10
19秒前
20秒前
20秒前
20秒前
foxp3完成签到,获得积分10
21秒前
顾矜应助冯岗采纳,获得10
22秒前
23秒前
foxp3发布了新的文献求助10
23秒前
yue发布了新的文献求助10
23秒前
小小兔完成签到,获得积分20
23秒前
24秒前
kajfksn完成签到,获得积分20
24秒前
王仙人发布了新的文献求助10
24秒前
zhuxiaonian完成签到,获得积分10
25秒前
纪间完成签到,获得积分10
25秒前
小小兔发布了新的文献求助10
26秒前
高分求助中
《郑州人》 2000
One Man Talking: Selected Essays of Shao Xunmei, 1929–1939 1000
Yuwu Song, Biographical Dictionary of the People's Republic of China 700
[Lambert-Eaton syndrome without calcium channel autoantibodies] 520
Sphäroguß als Werkstoff für Behälter zur Beförderung, Zwischen- und Endlagerung radioaktiver Stoffe - Untersuchung zu alternativen Eignungsnachweisen: Zusammenfassender Abschlußbericht 500
少脉山油柑叶的化学成分研究 430
Revolutions 400
热门求助领域 (近24小时)
化学 材料科学 医学 生物 有机化学 工程类 生物化学 纳米技术 物理 内科学 计算机科学 化学工程 复合材料 遗传学 基因 物理化学 催化作用 电极 光电子学 量子力学
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 2453729
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 2125692
关于积分的说明 5413027
捐赠科研通 1854381
什么是DOI,文献DOI怎么找? 922307
版权声明 562306
科研通“疑难数据库(出版商)”最低求助积分说明 493466