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Structure of Geobacter cytochrome OmcZ identifies mechanism of nanowire assembly and conductivity

硫化地杆菌 纳米线 地杆菌 电子传输链 生物膜 细胞色素 生物物理学 化学 纳米技术 材料科学 细菌 生物 生物化学 遗传学
作者
Yangqi Gu,Matthew J. Guberman‐Pfeffer,Vishok Srikanth,Cong Shen,Fabian Giska,Kallol Gupta,Yuri Y. Londer,Fadel A. Samatey,Víctor S. Batista,Nikhil S. Malvankar
出处
期刊:Nature microbiology [Nature Portfolio]
卷期号:8 (2): 284-298 被引量:120
标识
DOI:10.1038/s41564-022-01315-5
摘要

OmcZ nanowires produced by Geobacter species have high electron conductivity (>30 S cm−1). Of 111 cytochromes present in G. sulfurreducens, OmcZ is the only known nanowire-forming cytochrome essential for the formation of high-current-density biofilms that require long-distance (>10 µm) extracellular electron transport. However, the mechanisms underlying OmcZ nanowire assembly and high conductivity are unknown. Here we report a 3.5-Å-resolution cryogenic electron microscopy structure for OmcZ nanowires. Our structure reveals linear and closely stacked haems that may account for conductivity. Surface-exposed haems and charge interactions explain how OmcZ nanowires bind to diverse extracellular electron acceptors and how organization of nanowire network re-arranges in different biochemical environments. In vitro studies explain how G. sulfurreducens employ a serine protease to control the assembly of OmcZ monomers into nanowires. We find that both OmcZ and serine protease are widespread in environmentally important bacteria and archaea, thus establishing a prevalence of nanowire biogenesis across diverse species and environments. Cryo-EM structure of Geobacter cytochrome OmcZ nanowires identifies mechanism of electron conductance.
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