MecDDI: Clarified Drug–Drug Interaction Mechanism Facilitating Rational Drug Use and Potential Drug–Drug Interaction Prediction

药品 机制(生物学) 计算机科学 药物与药物的相互作用 集合(抽象数据类型) 补语(音乐) 风险分析(工程) 数据科学 药理学 医学 化学 表型 程序设计语言 互补 哲学 认识论 基因 生物化学
作者
Wei Hu,Wei Zhang,Ying Zhou,Yongchao Luo,Xiuna Sun,Huimin Xu,Shuiyang Shi,Teng Li,Yichao Xu,Qianqian Yang,Yunqing Qiu,Feng Zhu,Haibin Dai
出处
期刊:Journal of Chemical Information and Modeling [American Chemical Society]
卷期号:63 (5): 1626-1636 被引量:14
标识
DOI:10.1021/acs.jcim.2c01656
摘要

Drug-drug interactions (DDIs) are a major concern in clinical practice and have been recognized as one of the key threats to public health. To address such a critical threat, many studies have been conducted to clarify the mechanism underlying each DDI, based on which alternative therapeutic strategies are successfully proposed. Moreover, artificial intelligence-based models for predicting DDIs, especially multilabel classification models, are highly dependent on a reliable DDI data set with clear mechanistic information. These successes highlight the imminent necessity to have a platform providing mechanistic clarifications for a large number of existing DDIs. However, no such platform is available yet. In this study, a platform entitled "MecDDI" was therefore introduced to systematically clarify the mechanisms underlying the existing DDIs. This platform is unique in (a) clarifying the mechanisms underlying over 1,78,000 DDIs by explicit descriptions and graphic illustrations and (b) providing a systematic classification for all collected DDIs based on the clarified mechanisms. Due to the long-lasting threats of DDIs to public health, MecDDI could offer medical scientists a clear clarification of DDI mechanisms, support healthcare professionals to identify alternative therapeutics, and prepare data for algorithm scientists to predict new DDIs. MecDDI is now expected as an indispensable complement to the available pharmaceutical platforms and is freely accessible at: https://idrblab.org/mecddi/.
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