Methodology A rapid and inexpensive method for isolation of total DNA from Trichoderma spp (Hypocreaceae)

DNA提取 乙醇沉淀 菌丝体 色谱法 核酸 DNA 化学 多糖 基因组DNA 苯酚萃取 萃取(化学) 吸光度 十二烷基硫酸钠 生物化学 聚合酶链反应 微生物学 生物 植物 基因 核糖核酸
作者
Juan Carlos Vázquez-Angulo,Vianey Méndez-Trujillo,Daniel González-Mendoza,Adriana Morales,Onécimo Grimaldo-Juárez,Lourdes Cervantes-Díaz
出处
期刊:Genetics and Molecular Research [Research Foundation of Ribeirão Preto]
卷期号:11 (2): 1379-1384 被引量:9
标识
DOI:10.4238/2012.may.15.8
摘要

Extraction of high-quality genomic DNA for PCR amplification from filamentous fungi is difficult because of the complex cell wall and the high concentrations of polysaccharides and other secondary metabolites that bind to or co-precipitate with nucleic acids.We developed a modified sodium dodecyl sulfate/phenol protocol, without maceration in liquid nitrogen and without a final ethanol precipitation step.The A 260/280 absorbance ratios of isolated DNA were approximately 1.7-1.9,demonstrating that the DNA fraction is pure and can be used for analysis.Additionally, the A 260/230 values were higher than 1.6, demonstrating negligible contamination by polysaccharides.The DNA isolated by this protocol is of sufficient quality for molecular applications; this technique could be applied to other organisms that have similar substances that hinder DNA extraction.The main advantages of the method are that the mycelium is directly recovered from culture medium and it does not require the use of expensive and specialized equipment.

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