Up–Down Reader: An Open Source Program for Efficiently Processing 50% von Frey Thresholds

计算机科学 机械反应 金标准(测试) 人工智能 模式识别(心理学) 情报检索 医学 统计 数学 离子通道 内科学 受体
作者
Rafael González‐Cano,Bruno Boivin,Daniel Bullock,Laura Cornelissen,Nick Andrews,Michael Costigan
出处
期刊:Frontiers in Pharmacology [Frontiers Media]
卷期号:9 被引量:57
标识
DOI:10.3389/fphar.2018.00433
摘要

Most pathological pain conditions in patients and rodent pain models result in marked alterations in mechanosensation and the gold standard way to measure this is by use of von Frey fibers. These graded monofilaments are used to gauge the level of stimulus-evoked sensitivity present in the affected dermal region. One of the most popular methods used to determine von Frey thresholds is the up-down testing paradigm introduced by Dixon for patients in 1980 and by Chapman and colleagues for rodents in 1994. Although the up-down method is very accurate, leading to its widespread use, defining the 50% threshold from primary data is complex and requires a relatively time-consuming analysis step. We developed a computer program, the Up-Down Reader (UDReader), that can locate and recognize handwritten von Frey assessments from a scanned PDF document and translate these measurements into 50% pain thresholds. Automating the process of obtaining the 50% threshold values negates the need for reference tables or Microsoft Excel formulae and eliminates the chance of a manual calculation error. Our simple and straightforward method is designed to save research time while improving data collection accuracy and is freely available at https://sourceforge.net/projects/updownreader/ or in supplementary files attached to this manuscript.
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