Network toxicology, molecular docking and molecular dynamics simulation to explore the potential mechanism of nonylphenol induced cardiotoxicity

分子动力学 心脏毒性 机制(生物学) 小桶 对接(动物) 化学 壬基酚 计算生物学 转录因子 生物物理学 MAPK/ERK通路 基因调控网络 药理学 毒性 共芯 生物信息学 基因 结合位点 生物化学 神经毒性 系统生物学 作用机理 分子模型 生物
作者
Nana Huang,Yuanyuan Xiao,Xiaoyue Zhang,Yue Pan,Yonghong Xu,Fang Peng,Wenchao Tang
出处
期刊:International Journal of Environmental Health Research [Taylor & Francis]
卷期号:36 (5): 1097-1109
标识
DOI:10.1080/09603123.2025.2563057
摘要

This study aims to elucidate the potential mechanism of cardiotoxicity induced by nonylphenol (NP) through network toxicology, molecular docking and molecular dynamics simulation. With the help of Swisstarget prediction, the comparative toxicology database and genecards database, 197 genes related to NP-induced cardiac toxicity were identified as Potential target. Using the STRING database and cytoscape 3.10.1 software, 8 core targets (such as AKT1, MAPK3, STAT3) were further screened. GO and KEGG enrichment analyses showed that NP mainly affects PI3K-Akt, MAPK and JAK-STAT pathways, regulating cell apoptosis and inflammation. Molecular docking demonstrated that NP stably binds to the core target, and molecular dynamics simulations further verified the stability of the NP-MAPK3 complex, with a binding free energy of -1.215 kcal/mol, and the system exhibits good stability. In conclusion, NP may induce cardiotoxicity by interfering with PI3K-Akt, MAPK and other signaling pathways. This research provides a multi-dimensional methodological framework for analyzing the toxic mechanism of environmental pollutants, and lays the theoretical foundation for risk assessment and prevention strategies.
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