Viruses in Soil Ecosystems: An Unknown Quantity Within an Unexplored Territory

人病毒体 生物 基因组 生物多样性 生态系统 生态学 丰度(生态学) 生态系统服务 土壤水分 湿地 微生物生态学 物种丰富度 生物化学 遗传学 基因 细菌
作者
Kurt E. Williamson,Jeffry J. Fuhrmann,K. Eric Wommack,Mark Radosevich
出处
期刊:Annual Review of Virology [Annual Reviews]
卷期号:4 (1): 201-219 被引量:381
标识
DOI:10.1146/annurev-virology-101416-041639
摘要

Viral abundance in soils can range from below detection limits in hot deserts to over 1 billion per gram in wetlands. Abundance appears to be strongly influenced by water availability and temperature, but a lack of informational standards creates difficulties for cross-study analysis. Soil viral diversity is severely underestimated and undersampled, although current measures of viral richness are higher for soils than for aquatic ecosystems. Both morphometric and metagenomic analyses have raised questions about the prevalence of nontailed, ssDNA viruses in soils. Soil is complex and critically important to terrestrial biodiversity and human civilization, but impacts of viral activities on soil ecosystem services are poorly understood. While information from aquatic systems and medical microbiology suggests the potential for viral influences on nutrient cycles, food web interactions, gene transfer, and other key processes in soils, very few empirical data are available. To understand the soil virome, much work remains.

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