A Structure‐Controlled Investigation of Lipase Enantioselectivity by a Path‐Planning Approach

脂肪酶 伯克氏菌属 生物信息学 酯交换 化学 基质(水族馆) 活动站点 组合化学 立体中心 有机化学 对映选择合成 生物化学 催化作用 生物 细菌 基因 遗传学 生态学
作者
David Guieysse,Juan Cortés,Sophie Puech‐Guenot,Sophie Barbe,Vincent Lafaquière,Pierre Monsan,Thierry Siméon,Isabelle André,Magali Remaud‐Siméon
出处
期刊:ChemBioChem [Wiley]
卷期号:9 (8): 1308-1317 被引量:36
标识
DOI:10.1002/cbic.200700548
摘要

Abstract A novel approach based on efficient path‐planning algorithms was applied to investigate the influence of substrate access on Burkholderia cepacia lipase enantioselectivity. The system studied was the transesterification of 2‐substituted racemic acid derivatives catalysed by B. cepacia lipase. In silico data provided by this approach showed a fair qualitative agreement with experimental results, and hence the potential of this computational method for fast screening of racemates. In addition, a collision detector algorithm used during the pathway searches enabled the rapid identification of amino acid residues hindering the displacement of substrates along the deep, narrow active‐site pocket of B. cepacia lipase and thus provided valuable information to guide the molecular engineering of lipase enantioselectivity.

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
俏皮连虎完成签到,获得积分10
1秒前
1秒前
黎敏完成签到,获得积分10
2秒前
li发布了新的文献求助10
2秒前
2秒前
2秒前
karry发布了新的文献求助10
2秒前
朱丽君完成签到,获得积分10
2秒前
feng发布了新的文献求助10
2秒前
3秒前
充电宝应助九条条条采纳,获得10
3秒前
3秒前
香蕉觅云应助星星气球采纳,获得10
4秒前
4秒前
4秒前
123发布了新的文献求助30
5秒前
6秒前
星星发布了新的文献求助10
7秒前
lll发布了新的文献求助10
7秒前
黎敏发布了新的文献求助10
7秒前
Wzx发布了新的文献求助10
7秒前
怡然的凌兰应助LUCKY采纳,获得20
9秒前
10秒前
5523发布了新的文献求助30
11秒前
11秒前
zwj发布了新的文献求助10
12秒前
alt完成签到,获得积分20
13秒前
13秒前
123完成签到,获得积分10
14秒前
归尘发布了新的文献求助30
14秒前
Orange应助谦让的飞飞采纳,获得10
15秒前
chenlin发布了新的文献求助10
15秒前
orixero应助活力苏采纳,获得10
16秒前
顾矜应助IIIIIIIIII采纳,获得10
16秒前
星星气球发布了新的文献求助10
17秒前
19秒前
19秒前
21秒前
alt发布了新的文献求助10
23秒前
23秒前
高分求助中
(应助此贴封号)【重要!!请各用户(尤其是新用户)详细阅读】【科研通的精品贴汇总】 10000
Les Mantodea de Guyane Insecta, Polyneoptera 2000
Leading Academic-Practice Partnerships in Nursing and Healthcare: A Paradigm for Change 800
基于非线性光纤环形镜的全保偏锁模激光器研究-上海科技大学 800
Pulse width control of a 3-phase inverter with non sinusoidal phase voltages 777
Signals, Systems, and Signal Processing 610
Research Methods for Business: A Skill Building Approach, 9th Edition 500
热门求助领域 (近24小时)
化学 材料科学 医学 生物 纳米技术 工程类 有机化学 化学工程 生物化学 计算机科学 物理 内科学 复合材料 催化作用 物理化学 光电子学 电极 细胞生物学 基因 无机化学
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 6409951
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 8229120
关于积分的说明 17460211
捐赠科研通 5462989
什么是DOI,文献DOI怎么找? 2886620
邀请新用户注册赠送积分活动 1862972
关于科研通互助平台的介绍 1702306