Recommending What Drug to Prescribe Next for Accurate and Explainable Medical Decisions

药品 计算机科学 相似性(几何) 编码(集合论) 机器学习 数据科学 数据挖掘 医学 人工智能 药理学 图像(数学) 集合(抽象数据类型) 程序设计语言
作者
Panagiotis Symeonidis,Stergios Chairistanidis,Markus Zanker
标识
DOI:10.1109/cbms52027.2021.00021
摘要

Patients with complex diseases (i.e., cancer, diabetes, etc.) often follow a therapeutic that consists of multiple drugs, focusing at different human targets such as genes, proteins, etc. There is already related work in medical research for drug-target prediction and drug re-purposing. In this paper, we try to provide both accurate and explainable drug recommendations. In particular, we develop models to help doctors screen candidate drugs and their possible substitutes more comprehensively, by providing also robust explanations. To do this, we build a heterogeneous information network to capture the latent associations between patients, their therapeutics, the drugs used, and diseases nodes by using a meta path-based similarity measure. Based on previous similar patients' historical drug treatments, we can provide personalized drug recommendations along with explanations to support critical medical decisions. Demo code for our hybrid meta-based explanations can be found here. We have performed experiments on three real life data sets, which show that we can increase drastically the explainability of our drug recommendations by using more historical data, whereas the recommendations' accuracy still remains at a high level.
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