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Engineering Fully Human Monoclonal Antibodies from Murine Variable Regions

单克隆抗体 抗体 免疫原性 生物 蛋白质工程 去酰胺 分子生物学 计算生物学 遗传学 生物化学
作者
Matthew J. Bernett,Sher Karki,Gregory L. Moore,Matthew J. Bernett,Hsing Chen,Erik Pong,Duc-Hanh T. Nguyen,Jonathan Jacinto,Jonathan Zalevsky,Umesh Muchhal,John R. Desjarlais,Greg A. Lazar
出处
期刊:Journal of Molecular Biology [Elsevier]
卷期号:396 (5): 1474-1490 被引量:46
标识
DOI:10.1016/j.jmb.2009.12.046
摘要

Fully human monoclonal antibodies (mAbs) derived from transgenic mice or human antibody libraries are the current state of the art for reducing the immunogenicity risk of antibody drugs. Here, we describe a novel method for generating fully human mAbs from nonhuman variable regions using information from the human germline repertoire. Central to our strategy is the rational engineering of residues within and proximal to CDRs and the VH/VL interface by iteratively exploring substitutions to the closest human germline sequences using semi-automated computational methods. Starting from the parent murine variable regions of three currently marketed mAbs targeting CD25, vascular endothelial growth factor, and tumor necrosis factor alpha, we have generated fully human antibodies with 59, 46, and 45 substitutions, respectively, compared to the parent murine sequences. A large number of these substitutions were in the CDRs, which are typically avoided in humanization methods. Antigen affinities of the fully human variants were comparable to the chimeric mAbs in each case. Furthermore, in vitro functional characterization indicated that all retain potency of the chimeric mAbs and have comparable activity to their respective marketed drugs daclizumab, bevacizumab, and infliximab. Based on local and global sequence identity, the sequences of our engineered mAbs are indistinguishable from those of fully human mAbs isolated from transgenic mice or human antibody libraries. This work establishes a simple rational engineering methodology for generating fully human antibody therapeutics from murine mAbs produced from standard hybridoma technology.
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