Target Discovery for Drug Development Using Mendelian Randomization

孟德尔随机化 全基因组关联研究 疾病 协议(科学) 药品 计算生物学 药物开发 药物发现 计算机科学 医学 生物信息学 生物 单核苷酸多态性 遗传变异 遗传学 内科学 基因 药理学 基因型 病理 替代医学
作者
Daniel S. Evans
出处
期刊:Methods in molecular biology 卷期号:: 1-20 被引量:6
标识
DOI:10.1007/978-1-0716-2573-6_1
摘要

Making drug development more efficient by identifying promising drug targets can contribute to resource savings. Identifying promising drug targets using human genetic approaches can remove barriers related to translation. In addition, genetic information can be used to identify potentially causal relationships between a drug target and disease. Mendelian randomization (MR) is a class of approaches used to identify causal associations between pairs of genetically predicted traits using data from human genetic studies. MR can be used to prioritize candidate drug targets by predicting disease outcomes and adverse events that could result from the manipulation of a drug target. The theory behind MR is reviewed, including a discussion of MR assumptions, different MR analytical methods, tests for violations of assumptions, and MR methods that can be robust to some violations of MR assumptions. A protocol to perform two-sample MR (2SMR) with summary genome-wide association study (GWAS) results is described. An example of 2SMR examining the causal relationship between low-density lipoprotein (LDL) and coronary artery disease (CAD) is provided as an illustration of the protocol.
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