Identification and virtual screening of novel salty peptides from hydrolysate of tilapia by-product by batch molecular docking

水解物 虚拟筛选 对接(动物) 罗非鱼 化学 鉴定(生物学) 计算生物学 生化工程 生物技术 计算机科学 生物化学 生物 渔业 工程类 药物发现 水解 医学 生态学 护理部
作者
Hongjun Ren,Jingxuan Zhou,Huixian Fu,Qiaohui Feng,Jionghao Wang,Chuan Li,Guanghua Xia,Wenting Shang,Yanfu He
出处
期刊:Frontiers in Nutrition [Frontiers Media]
卷期号:10 被引量:11
标识
DOI:10.3389/fnut.2023.1343209
摘要

Introduction Tilapia produces a large number of by-products during processing, which contain potentially flavorful peptides. Methods The application of PyRx software enabled batch molecular docking andscreening of 16 potential salty peptides from 189 peptides identified in the enzymaticdigestion of tilapia by-products. Results According to sensory analysis, all 16 peptides werepredominantly salty with a threshold of 0.256 - 0.379 mmol/L with some sournessand astringency, among which HLDDALR had the highest salty intensity, followedby VIEPLDIGDDKVR, FPGIPDHL, and DFKSPDDPSRH. I addition, moleculardocking results showed these four core peptides with high salt intensity bound to thesalt receptor TRPV1 mainly via van der Waals interactions, hydrogen bonds, andhydrophobic forces; Arg491, Tyr487, VAL441, and Asp708 were the key sites for thebinding of salty peptides to TRPV1. Therefore, the application of batch moleculardocking using PyRx is effective and economical for the virtual screening of saltypeptides.
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