Identification and Molecular Mechanism of COX‐2 Inhibitors From Anisodus tanguticus: Ligand Fishing, In Vitro Validation, Molecular Docking, Molecular Dynamics, and ADMET Analysis

化学 分子动力学 分子模型 表面等离子共振 对接(动物) 药理学 广告 配体(生物化学) 体外 计算生物学 生物化学 立体化学 计算化学 受体 纳米颗粒 纳米技术 生物 医学 护理部 材料科学
作者
Su Rong,Yue Wang,Nixia Tan,Honglun Wang,Qi Dong
出处
期刊:Biomedical Chromatography [Wiley]
卷期号:39 (6)
标识
DOI:10.1002/bmc.70092
摘要

ABSTRACT Anisodus tanguticus (Maxim.) Pascher has demonstrated remarkable inhibitory effects on cyclooxygenase‐2 (COX‐2); however, the effective substances and molecular mechanism remain ambiguous. In this study, surface plasmon resonance (SPR) ligand fishing technology coupled with UPLC‐Q‐TOF‐MS analysis were applied to identify two COX‐2 binders, atropine and fabiatrin, from A. tanguticus extracts. In vitro assays verified their potent COX‐2 inhibitory effects, with IC 50 values of 16.63 and 10.66 mM, respectively. To elucidate the molecular mechanism underlying their inhibitory effects, we conducted molecular docking and molecular dynamics simulations. Interaction analysis revealed that both atropine and fabiatrin exhibit strong binding affinity and structural stability with COX‐2. Subsequent ADMET (absorption, distribution, metabolism, excretion, and toxicity) predictions indicated that atropine and fabiatrin had favorable pharmacokinetic properties and low toxicity, suggesting their potential as anti‐inflammatory agents. Notably, this is the first study to demonstrate the inhibitory effect of fabiatrin on COX‐2. Overall, the integrated approach developed here provides an efficient and reliable strategy for identifying bioactive components from complex traditional Chinese medicine (TCM) systems, which may offer a new perspective and scientific basis for the research and development of naturally targeted drugs.
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