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Expression, characterization, and activity optimization of a novel cellulase from the thermophilic bacteria Cohnella sp. A01

纤维素酶 热稳定性 嗜热菌 酶动力学 大肠杆菌 甘油 水解 化学 基质(水族馆) 水解酶 生物化学 生物 活动站点 基因 生态学
作者
Shabnam Mohammadi,Hossein Tarrahimofrad,Sareh Arjmand,Javad Zamani,Kamahldin Haghbeen,Saeed Aminzadeh
出处
期刊:Scientific Reports [Nature Portfolio]
卷期号:12 (1) 被引量:4
标识
DOI:10.1038/s41598-022-14651-7
摘要

Cellulases are hydrolytic enzymes with wide scientific and industrial applications. We described a novel cellulase, CelC307, from the thermophilic indigenous Cohnella sp. A01. The 3-D structure of the CelC307 was predicted by comparative modeling. Docking of CelC307 with specific inhibitors and molecular dynamic (MD) simulation revealed that these ligands bound in a non-competitive manner. The CelC307 protein was purified and characterized after recombinant expression in Escherichia coli (E. coli) BL21. Using CMC 1% as the substrate, the thermodynamic values were determined as Km 0.46 mM, kcat 104.30 × 10-3 (S-1), and kcat/Km 226.73 (M-1 S-1). The CelC307 was optimally active at 40 °C and pH 7.0. The culture condition was optimized for improved CelC307 expression using Plackett-Burman and Box-Behnken design as follows: temperature 20 °C, pH 7.5, and inoculation concentration with an OD600 = 1. The endoglucanase activity was positively modulated in the presence of Na+, Li+, Ca2+, 2-mercaptoethanol (2-ME), and glycerol. The thermodynamic parameters calculated for CelC307 confirmed its inherent thermostability. The characterized CelC307 may be a suitable candidate for various biotechnological applications.

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