Dexmedetomidine promotes necroptosis by upregulating PARP1 in non-small cell lung cancer

坏死性下垂 候选基因 生物 PARP1 基因 癌症研究 肺癌 非小细胞肺癌 免疫系统 肿瘤科 程序性细胞死亡 生物信息学 医学 免疫学 细胞凋亡 遗传学 A549电池 聚合酶 聚ADP核糖聚合酶
作者
Yang Liu,Xiao-dan Teng,Yubo Yan,Su Zhao,Guonian Wang
出处
期刊:Biotechnology & Genetic Engineering Reviews [Taylor & Francis]
卷期号:40 (2): 1281-1301
标识
DOI:10.1080/02648725.2023.2193469
摘要

The score and prognostic value of necroptosis were analyzed in the TCGA and GSE120622 datasets. Necroptosis has the highest correlation with the immune microenvironment, and the high score in NSCLC correlates with poor prognosis. Differentially expressed genes between non-small cell lung cancer (NSCLC) and controls in both datasets were identified and subjected to construct co-expression networks, respectively. Black and blue modules were selected because of high correction with necroptosis. The intersected two module genes were mainly involved in immune and inflammatory response, cell cycle process and DNA replication. Nine marker genes of necroptosis were identified in these modules and considered as candidate genes. Based on candidate genes, we identified two clusters utilizing concordance clustering, additionally dividing NSCLC samples into high- and low-risk groups. There were significant differences in overall survival between two clusters and between high- and low-risk groups. Furthermore, PARP1 was found among the candidate genes to be the target gene of dexmedetomidine acting on necroptosis. Molecular experimental results found that PARP1 was highly expressed in the dexmedetomidine treated NSCLC compared with the NSCLC. Candidate genes associated with necroptosis may provide a powerful prognostic tool for precision oncology. Dexmedetomidine may target PARP1 to promote necroptosis and then affect NSCLC.
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