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王锦蛇(Elaphe carinata)种群遗传结构及其影响因素 赵雨恬 南京师范大学 摘要:王锦蛇(Elaphe carinata),隶属于爬行纲(Reptilia),蛇目(Serpentiformes),游蛇科(Colubridae),锦蛇属(Elaphe),是一种常见的大型无毒蛇类。该物种广泛分布于我国的19个省市,分布区南缘可达广东北部、广西和贵州,北缘位于津京一带,分布区内生境多样,海拔可达2500m。了解中国大陆王锦蛇的遗传背景,评估其遗传多样性水平对揭示其种群遗传结构的现状及影响因素具有重要的科学意义。本研究测定了来自10个地理种群的85条王锦蛇的线粒体和核基因组来评估王锦蛇群体遗传多样性和遗传结构。其中,线粒体基因包括COI、cytb、ND2和ND4,序列全长3030bp;利用简化基因组测序(RAD-seq)开发出了271,903个单核苷酸多态性位点(single nucleotide polymorphism,SNP)。对线粒体和SNP位点进行整合分析后获得了以下具体结论:(1)王锦蛇群体以太行山脉—巫山为界呈东西方向上的显著分化,该模式的形成过程符合距离隔离(isolation-by-distance,IBD)模型,此外,环境因素也对该种群遗传结构的形成起到一... 更多 关键词: 王锦蛇;种群遗传结构;线粒体基因;SNP标记;种群遗传学; |
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