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某个蛋白在不同物种间的保守性
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1715
8
有点小不讲李
来自
云南
,
发表于:2023-10-16 09:52:57
有没有家人大佬知到不同物种间蛋白保守性在哪里查,怎么查呀,感谢分享
本帖完毕
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8楼
有点小不讲李
(楼主)
2023-11-17 15:38:53
发布自
云南
,
zarathustra
:
在NCBI的nucleotide里下载
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zarathustra
:
关键字不同结果也不同,如果没有其他物种也可能是因为其他物种数据本身就比较少。另外,现在AIGC非常好用,ChatGPT要花钱,国内有科大讯飞的讯飞星火用着还不错,prompt提的好的话人工智能会给出不错的学习方向和建议。
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嗯嗯 感谢感谢
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7楼
zarathustra
2023-11-13 14:25:09
发布自
上海
,
zarathustra
:
在NCBI的nucleotide里下载
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关键字不同结果也不同,如果没有其他物种也可能是因为其他物种数据本身就比较少。另外,现在AIGC非常好用,ChatGPT要花钱,国内有科大讯飞的讯飞星火用着还不错,prompt提的好的话人工智能会给出不错的学习方向和建议。
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6楼
有点小不讲李
(楼主)
2023-10-30 09:18:02
发布自
云南
,
白笑石
:
BLAST蛋白的同源序列,比对,构建进化树,比较保守性; 或者,uniprot上有蛋白family&domains
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有点小不讲李
:
大佬能否细说,有点迷,现在这个网站不是太了解,好多都不清楚,万分感谢
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白笑石
:
Uniprot是蛋白专用的序列库,包含所选择蛋白的所有信息。你可以先通过NCBI或者本蛋白的转录信息找到唯一的UNIPROT ID, 或者也可以通过uniprot网站内的blast功能找到。然后进入该蛋白的界面,下方左侧找到family;domain这个链接,跳转到该蛋白所有的功能位点及相近蛋白。
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谢谢大佬
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5楼
白笑石
2023-10-24 11:27:32
发布自
河北
,
白笑石
:
BLAST蛋白的同源序列,比对,构建进化树,比较保守性; 或者,uniprot上有蛋白family&domains
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有点小不讲李
:
大佬能否细说,有点迷,现在这个网站不是太了解,好多都不清楚,万分感谢
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Uniprot是蛋白专用的序列库,包含所选择蛋白的所有信息。你可以先通过NCBI或者本蛋白的转录信息找到唯一的UNIPROT ID, 或者也可以通过uniprot网站内的blast功能找到。然后进入该蛋白的界面,下方左侧找到family;domain这个链接,跳转到该蛋白所有的功能位点及相近蛋白。
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4楼
有点小不讲李
(楼主)
2023-10-22 12:31:47
发布自
中国
,
zarathustra
:
在NCBI的nucleotide里下载
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万分感谢,我搜索进去之后,最上面只有人的那个蛋白,没有其他物种的呀
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板凳
有点小不讲李
(楼主)
2023-10-22 12:28:33
发布自
中国
,
白笑石
:
BLAST蛋白的同源序列,比对,构建进化树,比较保守性; 或者,uniprot上有蛋白family&domains
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大佬能否细说,有点迷,现在这个网站不是太了解,好多都不清楚,万分感谢
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椅子
白笑石
2023-10-20 16:51:21
发布自
河北
,
BLAST蛋白的同源序列,比对,构建进化树,比较保守性; 或者,uniprot上有蛋白family&domains
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沙发
zarathustra
2023-10-17 14:11:50
发布自
上海
,
在NCBI的nucleotide里下载
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