Transcriptome sequencing analysis of primary fibroblasts: a new insight into postoperative abdominal adhesion

医学 纤维化 下调和上调 免疫系统 核糖核酸 细胞粘附 粘附 染色 转录组 病理 癌症研究 基因表达 基因 分子生物学 生物 免疫学 细胞 遗传学 化学 有机化学
作者
Fuling Wu,Yilei Li,Qin Yang,Canmao Wang,Lianbing Hou,Wenqin Liu,Chuqi Hou
出处
期刊:Surgery Today [Springer Science+Business Media]
卷期号:52 (1): 151-164 被引量:4
标识
DOI:10.1007/s00595-021-02321-6
摘要

The specific genes or pathways in fibroblasts responsible for the pathogenesis of postoperative abdominal adhesion (PAA) remain to be elucidated. We aim to provide a new insight into disease mechanisms at the transcriptome level.Male Sprague-Dawley rats were used to establish a PAA model. Primary fibroblasts were separated from normal peritoneal tissue (NF) and postoperative adhesion tissue (PF). RNA sequencing was used to analyze the transcriptome in NF and PF.One thousand two hundred thirty-five upregulated and 625 downregulated DEGs were identified through RNA-Seq. A pathway enrichment analysis identified distinct enriched biological processes, among which the most prominent was related to immune and inflammatory response and fibrosis. HE staining and Masson's trichrome staining histologically validated the RNA-Seq results. Six hub genes, ITGAM, IL-1β, TNF, IGF1, CSF1R and EGFR were further verified by RT-PCR.Our study revealed the roles of the immune and inflammatory responses and fibrosis in the process of PAA. We also found six hub genes that may be potential therapeutic targets for PPA.
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