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Protein Engineering of Substrate Specificity toward Nitrilases: Strategies and Challenges

硝化酶 蛋白质工程 底物特异性 生化工程 基质(水族馆) 区域选择性 催化效率 定向进化 计算机科学 生物技术 计算生物学 组合化学 化学 催化作用 生物化学 工程类 生物 基因 生态学 突变体
作者
Shi-Qian Bian,Zi-Kai Wang,Jin‐Song Gong,Chang Su,Heng Li,Zhenghong Xu,Jin‐Song Shi
出处
期刊:Journal of Agricultural and Food Chemistry [American Chemical Society]
卷期号:73 (3): 1775-1789 被引量:11
标识
DOI:10.1021/acs.jafc.4c09599
摘要

Nitrilase is extensively applied across diverse sectors owing to its unique catalytic properties. Nevertheless, in industrial production, nitrilases often face issues such as low catalytic efficiency, limited substrate range, suboptimal selectivity, and side reaction products, which have garnered heightened attention. With the widespread recognition that the structure of enzymes has a direct impact on their catalytic properties, an increasing number of researchers are beginning to optimize the functional characteristics of nitrilases by modifying their structures, in order to meet specific industrial or biotechnology application needs. Particularly in the artificial intelligence era, the innovative application of computer-aided design in enzyme engineering offers remarkable opportunities to tailor nitrilases for the widespread production of high-value products. In this discussion, we will briefly examine the structural mechanism of nitrilase. An overview of the protein engineering strategies of substrate preference, regioselectivity and stereoselectivity are explored combined with some representative examples recently in terms of the substrate specificity of enzyme. The future research trends in this field are also prospected.
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