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Characterization of Antibiotic Actinomycin D Isolated from Streptomyces parvulus Collected from Marine Sponge of Barrang Lompo Island, Makassar, Indonesia

海绵 16S核糖体RNA 链霉菌 系统发育树 生物 拉伤 抗菌活性 立体化学 核磁共振波谱 细菌 化学 植物 生物化学 基因 遗传学 解剖
作者
Herlina Rante,Gemini Alam,Yosi Bayu Murti,Alimuddin Ali
出处
期刊:Infectious disorders drug targets [Bentham Science Publishers]
卷期号:25 (4): e18715265306848-e18715265306848
标识
DOI:10.2174/0118715265306848240719061135
摘要

Background: Microorganisms associated with sea sponges have proven to be good natural product resources that are biologically active and pharmaceutically important. Objective: This research aimed to identify actinomycetes related to a sponge from Bar-ranglompo Island Makassar and the antibacterial compounds. Methods: Identification of actinomycetes was based on molecular characterization of sequence gen16S rRNA. The antibacterial compound was separated using vacuum liquid chromatog-raphy and preparative Thin Layer Chromatography (TLC). The structure determination was done based on spectroscopy 1H-NMR, 13C-NMR, 2D NMR, and mass spectra. Results: Molecular characterization showed that actinomycetes strain BLP 20 had the closest relationship with Streptomyces parvulus and Uncultured Streptomyces sp. with a similarity value of 83%. The results obtained from the characterization of antibacterial compounds based on spectroscopic data indicate that these compounds lead to Actinomycin D. Conclusion: Characterization and identification of Strain 20 / BLP by molecular phylogenetic analysis of 16S rRNA sequences revealed the closest relationship with Uncultured Streptomy-ces sp and S. parvulus with a similarity value of 83 %, which indicated a new species. The structure of the active compound isolated from actinomycetes strain 20 / BLP leads to Actino-mycin D.
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