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Structure of Vibrio collagenase VhaC provides insight into the mechanism of bacterial collagenolysis

胶原酶 弧菌 机制(生物学) 激活剂(遗传学) 化学 微生物学 劈理(地质) 毒力 细胞生物学 生物 生物化学 计算生物学
作者
Yu-Kai Wang,Peng Wang,Hai-Yan Cao,Hai-Tao Ding,Hai-Nan Su,Shi-Cheng Liu,Guangfeng Liu,Xi-Ying Zhang,Chun-Yang Li,Ming Peng,Fuchuan Li,Shuai Li,Yin Chen,Xiu-Lan Chen,Yu-Zhong Zhang
出处
期刊:Nature Communications [Springer Nature]
卷期号:13 (1)
标识
DOI:10.1038/s41467-022-28264-1
摘要

The collagenases of Vibrio species, many of which are pathogens, have been regarded as an important virulence factor. However, there is little information on the structure and collagenolytic mechanism of Vibrio collagenase. Here, we report the crystal structure of the collagenase module (CM) of Vibrio collagenase VhaC and the conformation of VhaC in solution. Structural and biochemical analyses and molecular dynamics studies reveal that triple-helical collagen is initially recognized by the activator domain, followed by subsequent cleavage by the peptidase domain along with the closing movement of CM. This is different from the peptidolytic mode or the proposed collagenolysis of Clostridium collagenase. We propose a model for the integrated collagenolytic mechanism of VhaC, integrating the functions of VhaC accessory domains and its collagen degradation pattern. This study provides insight into the mechanism of bacterial collagenolysis and helps in structure-based drug design targeting of the Vibrio collagenase.
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