SGF29 nuclear condensates reinforce cellular aging

交易激励 表观遗传学 染色质 H3K4me3 细胞生物学 细胞衰老 核运输 衰老 组蛋白 化学 转录因子 生物 计算生物学 基因表达 细胞核 基因 生物化学 DNA甲基化 核心 表型 发起人
作者
Yan Ke,Qianzhao Ji,Dongxin Zhao,Mingheng Li,Xiaoyan Sun,Zeshuai Wang,Xiaoqian Liu,Zunpeng Liu,Hongyu Li,Yingjie Ding,Si Wang,Juan Carlos Izpisúa Belmonte,Jing Qu,Weiqi Zhang,Guang‐Hui Liu
出处
期刊:Cell discovery [Springer Nature]
卷期号:9 (1) 被引量:1
标识
DOI:10.1038/s41421-023-00602-7
摘要

Abstract Phase separation, a biophysical segregation of subcellular milieus referred as condensates, is known to regulate transcription, but its impacts on physiological processes are less clear. Here, we demonstrate the formation of liquid-like nuclear condensates by SGF29, a component of the SAGA transcriptional coactivator complex, during cellular senescence in human mesenchymal progenitor cells (hMPCs) and fibroblasts. The Arg 207 within the intrinsically disordered region is identified as the key amino acid residue for SGF29 to form phase separation. Through epigenomic and transcriptomic analysis, our data indicated that both condensate formation and H3K4me3 binding of SGF29 are essential for establishing its precise chromatin location, recruiting transcriptional factors and co-activators to target specific genomic loci, and initiating the expression of genes associated with senescence, such as CDKN1A . The formation of SGF29 condensates alone, however, may not be sufficient to drive H3K4me3 binding or achieve transactivation functions. Our study establishes a link between phase separation and aging regulation, highlighting nuclear condensates as a functional unit that facilitate shaping transcriptional landscapes in aging.
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