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GIAO NMR Calculation-Driven Stereochemical Assignment of Marine Macrolide Natural Products: Assessment of the Performance of DP4 and DP4+ Analyses and Assignment of the Relative Configuration of Leptolyngbyalide A–C/Oscillariolide Macrolactone

化学 构象异构 化学位移 分子力学 计算化学 立体化学 人口 二维核磁共振波谱 分子 分子动力学 有机化学 物理化学 人口学 社会学
作者
Keisuke Murata,Hirotoshi Mori,Haruhiko Fuwa
出处
期刊:Bulletin of the Chemical Society of Japan [Oxford University Press]
卷期号:95 (12): 1775-1785 被引量:5
标识
DOI:10.1246/bcsj.20220253
摘要

The stereochemical assignment of marine macrolide natural products by quantum chemical calculations is often hampered by the generation of an intractable number of conformers in molecular mechanics conformation searches. In this study, we assessed in detail the application of GIAO NMR chemical shift calculation and DP4-type statistical analyses to the stereochemical assignment of two marine macrolide natural products, whose relative configurations had been incorrectly assigned in the originally proposed structures. We also examined how DP4+ probability was affected by cumulative Boltzmann population level of molecular mechanics-derived conformers. Finally, GIAO NMR chemical shift calculation/DP4-type statistical analysis was applied to leptolyngbyalide A–C/oscillariolide macrolactone, whose relative configuration has not been assigned so far. In this study, we examined application of theoretical NMR chemical shift calculation/DP4-type statistical analysis to the assignment of the relative configuration of three marine macrolide natural products with moderately flexible conformations. This study will serve as a practical guideline for the NMR calculation-driven configurational assignment of marine macrolides and relevant macrocyclic natural products.
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