Single-cell RNA sequencing highlights the role of inflammatory cancer-associated fibroblasts in bladder urothelial carcinoma

肿瘤微环境 癌症研究 膀胱癌 癌相关成纤维细胞 免疫原性 生物 免疫系统 癌症 转录组 免疫学 基因 肿瘤细胞 基因表达 遗传学
作者
Zhaohui Chen,Lijie Zhou,Lilong Liu,Yaxin Hou,Ming Xiong,Yu Yang,Junyi Hu,Ke Chen
出处
期刊:Nature Communications [Nature Portfolio]
卷期号:11 (1) 被引量:435
标识
DOI:10.1038/s41467-020-18916-5
摘要

Although substantial progress has been made in cancer biology and treatment, clinical outcomes of bladder carcinoma (BC) patients are still not satisfactory. The tumor microenvironment (TME) is a potential target. Here, by single-cell RNA sequencing on 8 BC tumor samples and 3 para tumor samples, we identify 19 different cell types in the BC microenvironment, indicating high intra-tumoral heterogeneity. We find that tumor cells down regulated MHC-II molecules, suggesting that the downregulated immunogenicity of cancer cells may contribute to the formation of an immunosuppressive microenvironment. We also find that monocytes undergo M2 polarization in the tumor region and differentiate. Furthermore, the LAMP3 + DC subgroup may be able to recruit regulatory T cells, potentially taking part in the formation of an immunosuppressive TME. Through correlation analysis using public datasets containing over 3000 BC samples, we identify a role for inflammatory cancer-associated fibroblasts (iCAFs) in tumor progression, which is significantly related to poor prognosis. Additionally, we characterize a regulatory network depending on iCAFs. These results could help elucidate the protumor mechanisms of iCAFs. Our results provide deep insight into cancer immunology and provide an essential resource for drug discovery in the future.
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