Novel rearrangements involving the RET gene in papillary thyroid carcinoma

融合基因 癌症研究 原癌基因蛋白质c-ret 甲状腺癌 基因重排 桑格测序 生物 癌变 蛋白激酶结构域 基因 RET原癌基因 受体酪氨酸激酶 遗传学 激酶 甲状腺 DNA测序 突变 种系突变 受体 突变体 神经营养因子 胶质细胞源性神经生长因子
作者
Julia I. Staubitz,Arno Schad,Erik Springer,Krishnaraj Rajalingam,Hauke Lang,Wilfried Roth,Nils Hartmann,Thomas J. Musholt
出处
期刊:Cancer genetics [Elsevier BV]
卷期号:230: 13-20 被引量:25
标识
DOI:10.1016/j.cancergen.2018.11.002
摘要

In the field of gene fusions driving tumorigenesis in papillary thyroid carcinoma (PTC), rearrangement of the proto-oncogene RET is the most frequent alteration. Apart from the most common rearrangement of RET to CCDC6, more than 15 partner genes are yet reported. The landscape of RET rearrangements in PTC ("RET-PTC") can notably be enlarged by modern targeted next-generation sequencing, indicating similarities between oncogenic pathways in other cancer types with identical genetic alterations.Targeted next-generation sequencing was performed for two cases of BRAF-wild type PTC with confirmation of the results by Sanger sequencing. A "UniProt" database research was performed to assess protein alterations resulting from RET rearrangements.RUFY2-RET and KIAA1468-RET were detected. The fusion genes were not present in normal tissue of the index patients. The rearrangement RUFY2-RET lead to a fusion of the RET tyrosine kinase domain to a RUN domain and a coiled-coil domain. For KIAA1468-RET, a fusion to a LisH domain and two coiled-coil domains resulted.RUFY2-RET and KIAA1468-RET are novel RET/PTC rearrangements. The fusions were previously described in non-small cell lung cancer. The rearrangement results in a fusion of the RET tyrosine kinase to regulatory domains of RUFY2 and KIAA1468.

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