Spectrum and tissue distribution of RB1 pathogenic alleles in mosaic retinoblastoma patients

生物 等位基因 遗传学 一致性 视网膜母细胞瘤 基因
作者
Yan Zhang,Wenbin Wei,Junyang Zhao,Xiaolin Xu,Fufeng Wang
出处
期刊:Ophthalmic Genetics [Taylor & Francis]
卷期号:43 (6): 795-805 被引量:1
标识
DOI:10.1080/13816810.2022.2098985
摘要

To characterize the spectrum of mosaic RB1 pathogenic alleles and map the distribution of mutant cells in available tissues from mosaic patients. Next-generation sequencing was performed on blood samples from 263 retinoblastoma families to identify mosaic RB1 variant alleles. A variety of available tissues were sampled to determine tissue distribution and fraction of mutant cells in five mosaic patients who consented to participate in mosaic pathogenic allele research. Twelve identified mosaic RB1 variants were all “null” pathogenic alleles and displayed reduced expressivity. The use of next-generation deep sequencing increased the sensitivity of mosaicism detection to 0.03% in the case of tissue DNA. In the five mosaic participants, we observed coherent but uneven, bilateral asymmetrical distribution of mutant cells across various tissues. They all carried early-embryonic mosaic pathogenic alleles and had significantly higher variant fractions in blood than in other tissues. Variant fractions of ipsilateral tissue samples were not concordant higher or lower compared with the contralateral side. Only ipsilateral conjunctival and oral epithelial cells showed concordance in mosaicism levels. No associations were observed between the laterality of affected eyes and variant fractions of any tissue type. NGS allows the detection of low-level mosaicism. Mosaic RB1 pathogenic alleles are prone to occur at very early stages of human embryonic development. With respect to genetic counseling, risk prediction should take into account unrecognized mosaicism. The underlying tissue distribution patterns of mosaic RB1 variant alleles remain to be determined.
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