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Methylation status of ADAM12 promoter are associated with its expression levels in colorectal cancer

结直肠癌 表观遗传学 CpG站点 亚硫酸氢盐测序 亚硫酸氢盐 甲基化 DNA甲基化 癌症研究 癌症 分子生物学 生物 遗传学 基因表达 基因
作者
Yan Wang,Jing Zhang,Hui Cao,Fengyan Han,Honghe Zhang,Enping Xu
出处
期刊:Pathology Research and Practice [Elsevier BV]
卷期号:221: 153449-153449 被引量:2
标识
DOI:10.1016/j.prp.2021.153449
摘要

Abstract Background Colorectal cancer (CRC) is a kind of malignant tumor of digestive system severely affecting human health. The occurrence of CRC is a polygenic and multi-step complex process involving genetic and epigenetic alterations. ADAM12 (a disintegrin and metalloproteases 12), is a gene that was commonly hypermethylated in esophageal cancer using whole-genome methylation microarray in our previous study. Methods We detected the methylation frequencies of the CpG island in ADAM12 promoter using bisulfite-pyrosequencing in CRC cell lines and tissue samples. The expression of ADAM12 was detected by quantitative real-time PCR (qRT-PCR) and immunohistochemistry (IHC). A systematic and comprehensive analysis of relationship of DNA hypermethylation and ADAM12 expression in CRC was performed in our samples and TCGA database. Results The expression of ADAM12 in hypermethylated cell lines was significantly lower than that in hypomethylated cell lines, and demethylation agent 5-Aza-dC could demethylate ADAM12 promoter region and reactivate ADAM12 expression effectively. In 74 pairs of colorectal cancer and normal tissues, bisulfite-pyrosequencing results showed significantly hypermethylation of ADAM12 in CRC compared with adjacent normal mucosa, accompanied with lower expression of ADAM12 in CRC tissues compared to that of the normal tissues. In addition, there was a statistically significant negative correlation between ADAM12 protein expression and methylation levels (rho =-0.28, p = 0.015). Conclusion Promoter hypermethylation was probably a mechanism of ADAM12 epigenetic silencing in CRC.
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