CUT&Tag Using “Stress-Free” Con A-Conjugated Dynabeads®

表观基因组 融合蛋白 计算生物学 组蛋白 适配器(计算) 染色质 转座酶 共轭体系 生物 基因组 化学 遗传学 计算机科学 基因 DNA 转座因子 基因表达 操作系统 有机化学 重组DNA DNA甲基化 聚合物
作者
Yasuhiro Fujiwara,Yuki Okada
出处
期刊:Methods in molecular biology [Springer Science+Business Media]
卷期号:: 141-153 被引量:2
标识
DOI:10.1007/978-1-0716-2433-3_16
摘要

Epigenome research has employed various methods to identify the genomic location of proteins of interest, such as transcription factors and histone modifications. CUT&Tag is a recently established method used in epigenome research to determine the genomic location of proteins of interest, such as transcription factors and histone modifications. In CUT&Tag method, cells are bound and hold on concanavalin A (con A)-coated magnetic beads, then a Protein-A Tn5 transposase fusion protein cuts the genome and inserts adapter sequences nearby the target protein. Here we describe the updated CUT&Tag procedure using "home-made" con A-conjugated magnetic beads. This method is free of poor suspendability and severe aggregation, hence providing improved sensitivity.

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