Investigation on electronic structure, vibrational spectra, NBO analysis, and molecular docking studies of aflatoxins and selected emerging mycotoxins against wild-type androgen receptor

自然键轨道 密度泛函理论 化学 计算化学 对接(动物) 粘结长度 分子几何学 大黄素 分子 有机化学 兽医学 生物化学 医学
作者
John A. Agwupuye,Peter Amba Neji,Hitler Louis,Joseph O. Odey,Tomsmith O. Unimuke,Emmanuel A. Bisiong,Ededet A. Eno,Patrick M. Utsu,Tabe N. Ntui
出处
期刊:Heliyon [Elsevier BV]
卷期号:7 (7): e07544-e07544 被引量:34
标识
DOI:10.1016/j.heliyon.2021.e07544
摘要

The geometry, frontier molecular orbitals (FMOs), vibrational, NBO analysis, and molecular docking simulations of aflatoxins (B1, B2, M1, M2, G1, G2), zearalenone (ZEA) emodin (EMO), alternariol (AOH), alternariol monoethyl ether (AMME), and tenuazonic acid (TeA) mycotoxins have been extensively theoretically studied and discussed based on quantum density functional theory calculations using Gaussian 16 software package. The theoretical computation for the geometry optimization, NBOs, and the molecular docking interaction was conducted using Density Functional Theory with B3LYP/6-31+G(d,p), NBO program, and AutoDock Vina tools respectively. Charge delocalization patterns and second-order perturbation energies of the most interacting natural bond orbitals (NBOs) of these mycotoxins have also been computed and predicted. Interestingly, among the mycotoxins investigated, aflatoxin G1 is seen to give the strongest stabilization energy while Zearalenone shows the highest tendency to accept electron(s) and emodin, an emerging mycotoxin gave the best binding pose within the androgen receptor pocket with a mean binding affinity of -7.40 kcal/mol.

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
1秒前
broo完成签到,获得积分10
1秒前
zhao发布了新的文献求助10
1秒前
kegelang发布了新的文献求助10
2秒前
2秒前
2秒前
小蘑菇应助Cc采纳,获得10
2秒前
3秒前
大模型应助英勇的梦旋采纳,获得10
3秒前
完美世界应助zyx采纳,获得10
3秒前
3秒前
XXXXXX完成签到,获得积分10
3秒前
3秒前
3秒前
Jason发布了新的文献求助10
4秒前
浮浮世世发布了新的文献求助10
4秒前
TXX发布了新的文献求助10
4秒前
清新的万天完成签到,获得积分10
4秒前
xxxx发布了新的文献求助10
4秒前
卧镁铀钳完成签到,获得积分10
4秒前
能干晓博发布了新的文献求助10
4秒前
5秒前
5秒前
wanci应助碧云天采纳,获得10
5秒前
不安的平萱完成签到,获得积分20
5秒前
5秒前
俊逸成危发布了新的文献求助30
5秒前
5秒前
6秒前
6秒前
思源应助一天三顿拼好饭采纳,获得10
6秒前
炼丹完成签到 ,获得积分10
6秒前
平常依秋发布了新的文献求助10
6秒前
zj发布了新的文献求助10
6秒前
hhl发布了新的文献求助10
6秒前
minbio完成签到,获得积分10
7秒前
爱听歌的八宝粥关注了科研通微信公众号
7秒前
叶辰发布了新的文献求助10
7秒前
997发布了新的文献求助30
8秒前
锡昱完成签到,获得积分10
8秒前
高分求助中
Principles of Economics, 11th Edition 10000
University Physics with Modern Physics, 16th edition 10000
(应助此贴封号)【重要!!请各用户(尤其是新用户)详细阅读】【科研通的精品贴汇总】 10000
Matrix Methods in Data Mining and Pattern Recognition 510
Social Skills Improvement System-Rating Scales--Chinese Version 500
Dynamische Polarisation von H-1 und B-11 in (CH-3)-3NBH-3 500
CLSI M07 2024 500
热门求助领域 (近24小时)
化学 材料科学 医学 生物 纳米技术 工程类 有机化学 化学工程 生物化学 计算机科学 内科学 物理 复合材料 催化作用 细胞生物学 无机化学 光电子学 物理化学 电极 基因
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 7250156
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 8872742
关于积分的说明 18725826
捐赠科研通 6929761
什么是DOI,文献DOI怎么找? 3198956
关于科研通互助平台的介绍 2374158
邀请新用户注册赠送积分活动 2173671