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An Angiogenesis-Related lncRNA Signature Is Associated with Prognosis and Tumor Immune Microenvironment in Breast Cancer

血管生成 比例危险模型 乳腺癌 肿瘤科 单变量 单变量分析 医学 癌症研究 癌症 免疫系统 肿瘤微环境 内科学 多元分析 生物 多元统计 免疫学 统计 数学
作者
Shun Gao,Yong Wang,Yingkun Xu,Shengchun Liu
出处
期刊:Journal of Personalized Medicine [Multidisciplinary Digital Publishing Institute]
卷期号:13 (3): 513-513
标识
DOI:10.3390/jpm13030513
摘要

Angiogenesis is crucial in the development and progression of tumors. This study examined the relationship between angiogenesis-related lncRNAs (AR-lncRNAs) and breast cancer (BC) immunity and prognosis. We used univariate Cox regression analysis to obtain AR-lncRNAs closely related to BC prognosis. Cluster analysis of BC patients was performed using non-negative matrix factorization (NMF) analysis according to the expression of AR-lncRNAs that were prognostically relevant. An AR-lncRNA risk model (AR-lncM) was created using LASSO regression analysis to predict the prognosis and survival of BC patients. Subsequently, the effect of LINC01614 on cell migration and invasion was verified by Transwell and Western blot assays, and the CCK-8 assay detected its impact on cell sensitivity to tamoxifen. Finally, we obtained 17 AR-lncRNAs from the TCGA database that were closely associated with the prognosis of BC patients. Based on the expression of these AR-lncRNAs, BC patients were divided into five clusters using NMF analysis. Cluster 1 was found to have a better prognosis, higher expression of immune checkpoints, and higher levels of immune cell infiltration. Furthermore, an AR-LncM model was created using ten prognostic-related AR-lncRNAs. The model’s risk predictive performance was validated using survival analysis, timeROC curves, and univariate and multivariate Cox analysis. The most interesting gene in the model, LINC01614, was found to regulate epithelial-mesenchymal transition (EMT) and tamoxifen sensitivity in BC cells, implying that LINC01614 could be a potential therapeutic target for BC patients.
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