Integration of the Drug–Gene Interaction Database (DGIdb 4.0) with open crowdsource efforts

应用程序编程接口 规范化(社会学) 文档 基因相互作用 交互网络 接口(物质) 可药性 数据库 计算机科学 交互信息 资源(消歧) 生物 基因 数学 计算机网络 统计 生物化学 最大气泡压力法 人类学 社会学 气泡 并行计算 程序设计语言
作者
Sharon Freshour,Susanna Kiwala,Kelsy C. Cotto,Adam C. Coffman,Joshua F. McMichael,Jonathan J Song,Malachi Griffith,Alex H. Wagner
出处
期刊:Nucleic Acids Research [Oxford University Press]
卷期号:49 (D1): D1144-D1151 被引量:470
标识
DOI:10.1093/nar/gkaa1084
摘要

Abstract The Drug-Gene Interaction Database (DGIdb, www.dgidb.org) is a web resource that provides information on drug-gene interactions and druggable genes from publications, databases, and other web-based sources. Drug, gene, and interaction data are normalized and merged into conceptual groups. The information contained in this resource is available to users through a straightforward search interface, an application programming interface (API), and TSV data downloads. DGIdb 4.0 is the latest major version release of this database. A primary focus of this update was integration with crowdsourced efforts, leveraging the Drug Target Commons for community-contributed interaction data, Wikidata to facilitate term normalization, and export to NDEx for drug-gene interaction network representations. Seven new sources have been added since the last major version release, bringing the total number of sources included to 41. Of the previously aggregated sources, 15 have been updated. DGIdb 4.0 also includes improvements to the process of drug normalization and grouping of imported sources. Other notable updates include the introduction of a more sophisticated Query Score for interaction search results, an updated Interaction Score, the inclusion of interaction directionality, and several additional improvements to search features, data releases, licensing documentation and the application framework.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
更新
大幅提高文件上传限制,最高150M (2024-4-1)

科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
listen发布了新的文献求助10
1秒前
科研通AI2S应助ZeNing采纳,获得10
1秒前
半山发布了新的文献求助10
2秒前
zsl完成签到,获得积分10
3秒前
5秒前
小马甲应助科研通管家采纳,获得10
6秒前
酷波er应助科研通管家采纳,获得10
6秒前
MP应助科研通管家采纳,获得10
6秒前
MP应助科研通管家采纳,获得10
6秒前
6秒前
wangjingli666应助科研通管家采纳,获得10
6秒前
6秒前
大模型应助石开222采纳,获得10
7秒前
大海完成签到,获得积分10
7秒前
listen完成签到,获得积分10
7秒前
Autumn完成签到 ,获得积分20
8秒前
amateur应助阳光的中蓝采纳,获得10
10秒前
zyz924发布了新的文献求助10
10秒前
11秒前
半山完成签到,获得积分10
12秒前
情怀应助苹果尔曼采纳,获得10
13秒前
13秒前
脑洞疼应助lwq采纳,获得10
13秒前
14秒前
Jack完成签到,获得积分10
15秒前
斯文败类应助科研小迷糊采纳,获得10
16秒前
17秒前
哈哈哈完成签到,获得积分10
19秒前
简单发布了新的文献求助10
19秒前
19秒前
rabbit发布了新的文献求助30
20秒前
22秒前
24秒前
852应助哈哈哈采纳,获得10
25秒前
石开222发布了新的文献求助10
27秒前
31秒前
沐沐完成签到,获得积分20
33秒前
35秒前
小陈老板发布了新的文献求助100
36秒前
36秒前
高分求助中
Manual of Clinical Microbiology, 4 Volume Set (ASM Books) 13th Edition 1000
Teaching Social and Emotional Learning in Physical Education 900
The three stars each : the Astrolabes and related texts 550
Boris Pesce - Gli impiegati della Fiat dal 1955 al 1999 un percorso nella memoria 500
Chinese-English Translation Lexicon Version 3.0 500
Recherches Ethnographiques sue les Yao dans la Chine du Sud 500
[Lambert-Eaton syndrome without calcium channel autoantibodies] 460
热门求助领域 (近24小时)
化学 材料科学 医学 生物 有机化学 工程类 生物化学 纳米技术 物理 内科学 计算机科学 化学工程 复合材料 遗传学 基因 物理化学 催化作用 电极 光电子学 量子力学
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 2399534
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 2100261
关于积分的说明 5294989
捐赠科研通 1828099
什么是DOI,文献DOI怎么找? 911204
版权声明 560133
科研通“疑难数据库(出版商)”最低求助积分说明 487058