A multi-task prediction method based on neighborhood structure embedding and signed graph representation learning to infer the relationship between circRNA, miRNA, and cancer

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作者
Lan Huang,Xin-Fei Wang,Yan Wang,Renchu Guan,Nan Sheng,Xuping Xie,Lei Wang,Ziqi Zhao
出处
期刊:Briefings in Bioinformatics [Oxford University Press]
卷期号:25 (6)
标识
DOI:10.1093/bib/bbae573
摘要

Research shows that competing endogenous RNA is widely involved in gene regulation in cells, and identifying the association between circular RNA (circRNA), microRNA (miRNA), and cancer can provide new hope for disease diagnosis, treatment, and prognosis. However, affected by reductionism, previous studies regarded the prediction of circRNA-miRNA interaction, circRNA-cancer association, and miRNA-cancer association as separate studies. Currently, few models are capable of simultaneously predicting these three associations.
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