Deep learning system for classification of ploidy status using time-lapse videos

计算机科学 人工智能 卷积神经网络 编码 感知器 学习迁移 深度学习 模式识别(心理学) 人工神经网络 特征(语言学) 机器学习 帧(网络) 数据挖掘 生物 基因 哲学 电信 生物化学 语言学
作者
Elena Payá,Cristian Pulgarín,Lorena Bori,Adrián Colomer,Valery Naranjo,Marcos Meseguer
出处
期刊:F&S science [Elsevier]
卷期号:4 (3): 211-218 被引量:6
标识
DOI:10.1016/j.xfss.2023.06.002
摘要

To develop a spatiotemporal model for de prediction of euploid and aneuploid embryos using time-lapse videos from 10-115 hours after insemination (hpi).Retrospective study.The research used an end-to-end approach to develop an automated artificial intelligence system capable of extracting features from images and classifying them, considering spatiotemporal dependencies. A convolutional neural network extracted the most relevant features from each video frame. A bidirectional long short-term memory layer received this information and analyzed the temporal dependencies, obtaining a low-dimensional feature vector that characterized each video. A multilayer perceptron classified them into 2 groups, euploid and noneuploid.The model performance in accuracy fell between 0.6170 and 0.7308. A multi-input model with a gate recurrent unit module performed better than others; the precision (or positive predictive value) is 0.8205 for predicting euploidy. Sensitivity, specificity, F1-Score and accuracy are 0.6957, 0.7813, 0.7042, and 0.7308, respectively.This article proposes an artificial intelligence solution for prioritizing euploid embryo transfer. We can highlight the identification of a noninvasive method for chromosomal status diagnosis using a deep learning approach that analyzes raw data provided by time-lapse incubators. This method demonstrated potential automation of the evaluation process, allowing spatial and temporal information to encode.

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