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Distinguishing septic shock from non-septic shock in postsurgical patients using gene expression

感染性休克 降钙素原 医学 休克(循环) 接收机工作特性 基因 微阵列 队列 微阵列分析技术 内科学 免疫学 基因表达 败血症 生物信息学 生物 遗传学
作者
Pedro Martínez-Paz,M. Aragón-Camino,Esther Gómez‐Sánchez,Mario Lorenzo‐López,Estefanía Gómez‐Pesquera,A. Fadrique Fuentes,Pilar Liu,Álvaro Tamayo-Velasco,Christian Ortega-Loubón,Marta Martín-Fernández,Hugo Gonzalo‐Benito,Emilio García‐Morán,María Heredia‐Rodríguez,Eduardo Tamayo
出处
期刊:Journal of Infection [Elsevier BV]
卷期号:83 (2): 147-155 被引量:24
标识
DOI:10.1016/j.jinf.2021.05.039
摘要

Objectives To obtain a gene expression signature to distinguish between septic shock and non-septic shock in postoperative patients, since patients with both conditions show similar signs and symptoms. Methods Differentially expressed genes were selected by microarray analysis in the discovery cohort. These genes were evaluated by quantitative real time polymerase chain reactions in the validation cohort to determine their reliability and predictive capacity by receiver operating characteristic curve analysis. Results Differentially expressed genes selected were IGHG1, IL1R2, LCN2, LTF, MMP8, and OLFM4. The multivariate regression model for gene expression presented an area under the curve value of 0.922. These genes were able to discern between both shock conditions better than other biomarkers used for diagnosis of these conditions, such as procalcitonin (0.589), C-reactive protein (0.705), or neutrophils (0.605). Conclusions Gene expression patterns provided a robust tool to distinguish septic shock from non-septic shock postsurgical patients and shows the potential to provide an immediate and specific treatment, avoiding the unnecessary use of broad-spectrum antibiotics and the development of antimicrobial resistance, secondary infections and increase health care costs.
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