C-to-U and U-to-C: RNA editing in plant organelles and beyond

RNA编辑 生物 细胞器 基因组 核糖核酸 基因 叶绿体 遗传学 功能(生物学) 计算生物学 转移RNA
作者
Volker Knoop
出处
期刊:Journal of Experimental Botany [Oxford University Press]
卷期号:74 (7): 2273-2294 被引量:19
标识
DOI:10.1093/jxb/erac488
摘要

The genomes in the two energy-converting organelles of plant cells, chloroplasts and mitochondria, contain numerous 'errors' that are corrected at the level of RNA transcript copies. The genes encoded in the two endosymbiotic organelles would not function properly if their transcripts were not altered by site-specific cytidine-to-uridine (C-to-U) exchanges and by additional reverse U-to-C exchanges in hornworts, lycophytes, and ferns. These peculiar processes of plant RNA editing, re-establishing genetic information that could alternatively be present at the organelle genome level, has spurred much research over >30 years. Lately new studies have revealed numerous interesting insights, notably on the biochemical machinery identifying specific pyrimidine nucleobases for conversion from C to U and vice versa. Here, I will summarize prominent research findings that lately have contributed to our better understanding of these phenomena introducing an added layer of information processing in plant cells. Some of this recent progress is based on the successful functional expression of plant RNA editing factors in bacteria and mammalian cells. These research approaches have recapitulated natural processes of horizontal gene transfer through which some protist lineages seem to have acquired plant RNA editing factors and adapted them functionally for their own purposes.
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