De novo design and structure of a peptide–centric TCR mimic binding module

T细胞受体 主要组织相容性复合体 生物信息学 人类白细胞抗原 抗原 细胞毒性 计算生物学 生物物理学 化学 受体 分子生物学 生物 体外 生物化学 免疫学 免疫系统 T细胞 基因
作者
Karsten D. Householder,Xinyu Xiang,Kevin M. Jude,Arthur Deng,Matthias Obenaus,Yang Zhao,Steven C. Wilson,Xiaojing Chen,Nan Wang,K. Christopher García
出处
期刊:Science [American Association for the Advancement of Science]
卷期号:389 (6758): 375-379 被引量:20
标识
DOI:10.1126/science.adv3813
摘要

T cell receptor (TCR) mimics offer a promising platform for tumor-specific targeting of peptide–major histocompatibility complex (pMHC) in cancer immunotherapy. In this study, we designed a de novo α-helical TCR mimic (TCRm) specific for the NY-ESO-1 peptide presented by human leukocyte antigen (HLA)–A*02, achieving high on-target specificity with nanomolar affinity (dissociation constant K d = 9.5 nM). The structure of the TCRm-pMHC complex at 2.05-Å resolution revealed a rigid TCR-like docking mode with an unusual degree of focus on the up-facing NY-ESO-1 side chains, suggesting the potential for reduced off-target reactivity. Indeed, a structure-informed in silico screen of 14,363 HLA-A*02 peptides correctly predicted two off-target peptides, yet our TCRm maintained peptide selectivity and cytotoxicity as a T cell engager. These results represent a path for precision targeting of tumor antigens with peptide-focused α-helical TCR mimics.
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