Construction and validation of a TP53-associated immune prognostic model for gastric cancer

BTLA公司 列线图 生物 免疫系统 队列 免疫分型 肿瘤科 间质细胞 免疫疗法 癌症研究 内科学 T细胞 免疫学 流式细胞术 医学
作者
Kechao Nie,Zhihua Zheng,Yi Wen,Laner Shi,Shjie Xu,Xueqi Wang,Yingsheng Zhou,Bin Fu,Xiushen Li,Zhitong Deng,Jinglin Pan,Xiaotao Jiang,Kailin Jiang,Yanhua Yan,Kunhai Zhuang,Wei Huang,Fengbin Liu,Peiwu Li
出处
期刊:Genomics [Elsevier BV]
卷期号:112 (6): 4788-4795 被引量:29
标识
DOI:10.1016/j.ygeno.2020.08.026
摘要

Increasing evidence indicates that TP53 mutation impacts the patients' prognosis by regulating the gastric cancer (GC) immunophenotype. An immune prognostic signature (IPS) was constructed based on TP53 status. The effects of the IPS on the immune microenvironment of GC were analyzed. We also constructed a nomogram integrating the IPS and other clinical factors. An IPS was constructed in the TCGA cohort and validated in the meta-GEO cohort. TP53 mutation resulted in the downregulation of the immune response in GC. Concretely, high-risk patients were characterized by increased monocyte, macrophage M0 and T cell follicular helper infiltration; increased stromal score, ESTIMATE score and immune score; higher TIM3 and BTLA expression; and decreased dendritic cell and T cell CD4 memory-activated infiltration and tumor purity. The nomogram also showed good predictive performance. These results suggest that the IPS is an effective prognostic indicator for GC patients, which might provide a theoretical foundation for immunotherapy.

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