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Genomic DNA Sequence and Transcription Factor Binding Sites of Mouse Ninjurin

生物 DNA结合位点 序列(生物学) 计算生物学 发起人 基因 遗传学 进化生物学 转录因子 DNA DNA测序 基因表达
作者
Ae Ran Moon,Goo Taeg Oh,Jae Wha Kim,Young Jin Cho,In Seong Choe
出处
期刊:Dna Sequence 卷期号:12 (5-6): 385-395 被引量:4
标识
DOI:10.3109/10425170109084463
摘要

The complete genomic DNA sequence of mouse ninjurin gene has been cloned and sequenced by screening a bacterial artificial chromosome (BAC) library of mouse 129/SvJ genomic DNA. The mouse ninjurin gene comprises four exons and the translatable sequences are included in the first three exons. The putative promoter region of the mouse ninjurin gene lacks the consensus “CAAT” or “TATA” sequence. Nonetheless, it has demonstrated the promoter activity in transient transfection experiment using the construct containing putative promoter sequence of mouse ninjurin and reporter gene. The nucleotide sequence of the putative promoter region shows 83% homology with the corresponding DNA sequence of human ninjurin gene that had been previously reported, and reveals a high degree of conservation between the two species. Analysis of the DNA sequence identified the putative promoters and the binding sites for a variety of transcription factors of mouse ninjurin.
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