A spectroscopic, molecular docking and molecular dynamic simulation study on the interaction of human hemoglobin with 2,4-dichlorophenoxyacetic acid

分子动力学 血红蛋白 2,4-二氯苯氧基乙酸 对接(动物) 化学 分子模型 计算化学 计算生物学 立体化学 生物化学 生物 医学 植物 护理部
作者
Ruhul Quds,Md Amiruddin Hashmi,Monika Sharma,Riaz Mahmood
出处
期刊:Journal of Biomolecular Structure & Dynamics [Taylor & Francis]
卷期号:: 1-13
标识
DOI:10.1080/07391102.2025.2496770
摘要

2,4-Dichlorophenoxyacetic acid (2,4-D) is a systemic herbicide widely used to control dicotyledonous weeds. The general population is routinely exposed to 2,4-D due to consumption of contaminated food and water. 2,4-D is known to damage cellular components in human erythrocytes. This study investigated in detail the interaction of 2,4-D with human hemoglobin (Hb), the major protein in erythrocytes (>95%), and characterized the binding properties utilizing multi-spectrometric and in silico techniques. The UV-visible spectra suggested that 2,4-D interacts with Hb. The fluorescence quenching studies at three different temperatures further showed the binding of 2,4-D to Hb and the formation of a ground-state complex. The results indicated that 2,4-D binds spontaneously to a single moderate-affinity binding site on Hb. Furthermore, the binding process involved van der Waals forces and hydrogen bonding. Circular dichroism and synchronous fluorescence spectra showed that the binding of 2,4-D altered the conformation of Hb and decreased the polarity around its tryptophan residues. 2,4-D binding inhibited the inherent esterase activity of Hb. Computational analysis demonstrated that the Hb-2,4-D complex was stable and identified the amino acid residues at the binding site. Thus, 2,4-D interacts with Hb, modifies the protein conformation and consequently impairs its functions.
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