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Accelerating PROTACs Discovery Through a Direct‐to‐Biology Platform Enabled by Modular Photoclick Chemistry

药物发现 模块化设计 合成生物学 纳米技术 化学生物学 组合化学 计算生物学 计算机科学 生化工程 化学 生物 材料科学 工程类 生物化学 操作系统
作者
Ke‐Nian Yan,Yao Nie,Jiayu Wang,Guoqiang Yin,Qia Liu,Hao Hu,Xiaoxia Sun,Xiaohua Chen
出处
期刊:Advanced Science [Wiley]
卷期号:11 (26): e2400594-e2400594 被引量:27
标识
DOI:10.1002/advs.202400594
摘要

Proteolysis targeting chimeras (PROTACs) have emerged as a promising strategy for drug discovery and exploring protein functions, offering a revolutionary therapeutic modality. Currently, the predominant approach to PROTACs discovery mainly relies on an empirical design-synthesis-evaluation process involving numerous cycles of labor-intensive synthesis-purification and bioassay data collection. Therefore, the development of innovative methods to expedite PROTAC synthesis and exploration of chemical space remains highly desired. Here, a direct-to-biology strategy is reported to streamline the synthesis of PROTAC libraries on plates, enabling the seamless transfer of reaction products to cell-based bioassays without the need for additional purification. By integrating amide coupling and light-induced primary amines and o-nitrobenzyl alcohols cyclization (PANAC) photoclick chemistry into a plate-based synthetic process, this strategy produces PROTAC libraries with high efficiency and structural diversity. Moreover, by employing this platform for PROTACs screening, we smoothly found potent PROTACs effectively inhibit triple-negative breast cancer (TNBC) cell growth and induce rapid, selective targeted degradation of cyclin-dependent kinase 9 (CDK9). The study introduces a versatile platform for assembling PROTACs on plates, followed by direct biological evaluation. This approach provides a promising opportunity for high-throughput synthesis of PROTAC libraries, thereby enhancing the efficiency of exploring chemical space and accelerating the discovery of PROTACs.
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